Konjonktivitin tedavisi duruma neyin neden olduğuna bağlıdır. Her şekilde, günde birkaç kez, etkilenen göze uygulanan ılık kompresler rahatsızlığın azalmasını sağlayabilir. Viral enfeksiyona özellikle de adenovirüslere bağlı olan konjonktivit, genellikle göz(ler)e ılık kompresler tatbik edilmesiyle ve ikincil bakteriyel enfeksiyonların önlenmesi amacıyla topikal antimikrobiyal merhemlerin uygulanmasıyla tedavi edilir.
Viral konjonktivit körlüğe neden olabilir ve bir göz doktoruna başvurulması gerekir. Antiviral terapi ile birlikte topikal steroidler de yaygın şekilde yazılmaktadır. Bakteriyel konjonktivit durumunda doktor antibiyotikli bir göz merhemi ya da günlük olarak, 7-14 gün boyunca uygulanacak sodyum sulfacemit (Sulamyd) içeren göz damlaları yazabilir. Gözde 72 saat içinde herhangi bir düzelme görülmezse doktorla temasa geçilmelidir. Antibiyotikli göz damlaları, hastanın başı arkaya yatırılarak ve alttaki göz kapağı çekilerek göze damlatılır (damla damla yerleştirilir). Konjunktival keseye ilaç damlatılırken hastadan yukarı bakması istenir. Göz akıntısının antibiyotik solüsyona bulaşmasını önlemek için damlalığın deriye değmesinden kaçınmak önemlidir. Damlaların damlatılmasının ardından ilacın dışarı çıkmasını önlemek için hastanın yavaşça gözlerini yumarak bir dakika kadar kapalı tutması sağlanmalıdır.
Konjonktivite, gonokok (belsoğukluğuna yol açan bakteri) neden olduğunda, doktor seftriakson (Rocephin) enjeksiyonu ve 2-3 hafta boyunca günde dört kez uygulanacak eritromisin ya da baktrasin içeren topikal bir antibiyotik merhem yazabilir. Klamidyal enfeksiyonlarda, günde 1-2 kez tatbik edilecek şekilde, eritromisin içeren (Ilotycin) bir topikal antibiyotik merhem yazılabilir. Antibiyotikli bir merhemi tatbik etmek üzere, herhangi bir akıntıyı temizlemek için göz steril su ile nemlendirilmiş bir parça pamuk ile silinir. Sonrasında, alt gözkapağı aşağı çekilir ve ince bir şerit şeklinde çıkan merhem alttaki konjunktival keseye tatbik edilir. Mümkünse merhem, ilaca başka maddelerin bulaşmasını önlemek adına tek kullanımlık bir dağıtıcı ile kullanılmalıdır. Merhemi dağıtmak için göz kapakları kapatılabilir ve kapaklara yavaşça masaj yapılabilir. Hastalar merhem tatbik edildikten sonra birkaç dakika kadar etrafı bulanık görebilir, ancak bu normal bir yan etkidir. Topikal antibiyotiklere ek olarak, 3-4 hafta kadar oral yoldan eritromisin ya da tetrasklin terapisi de uygun olabilir. Cinsel partnerlerin de tedavi edilmeleri gerekir.
2002 yılında yayınlanan klinik bulgulara göre konjonktivit olan çocuklar da genel olarak topikal antibiyotikler almalıdır. Ancak bulgular gonokokkal olmayan konjonktiviti bulunan yetişkinlerin genellikle antibiyotik tedavisine ihtiyaç duymadıklarını da tekrar vurgulamaktadır, çünkü antibiyotik direnci çoğalan bir sorundur.
Alerjik konjonktivit, alerjiye neden olan maddenin, eğer mümkünse, kişinin etrafından uzaklaştırılmasıyla, göze soğuk kompres tatbik edilmesiyle, dört gün boyunca günde 4-6 kez göz damlası uygulanmasıyla tedavi edilebilir.
Kaşınan gözlerin rahatlamasına antihistamik difenhidramin hidroklorit (Benadryl) yardımcı olabilir. 2002 yılında yapılan yeni bir çalışma loteprednol ve azelastinin alerjik konjonktivit için iki potansiyel tedavi olduğunu ortaya koymuştur. Bazı doktorlar optalimik steroidler yazmaktadır; ancak bunlar hastada komplikasyonlara neden olabilir. Bu potansiyel olarak yeni tedaviler alerjik konjonktiviti olan hastalar için steroidlere alternatif tedaviler sunmaktadır.